tomoari:~% sudo pacman -Syu
:: Synchronizing package databases...
:: Starting full system upgrade...
resolving dependencies...
looking for inter-conflicts...

Targets (40): (略)

Total Download Size:    30.87 MiB
Total Installed Size:   433.45 MiB
Net Upgrade Size:       0.80 MiB

Proceed with installation? [Y/n] y
(40/40) checking package integrity                       [##############################] 100%
(40/40) loading package files                            [##############################] 100%
(40/40) checking for file conflicts                      [##############################] 100%
error: failed to commit transaction (conflicting files)
glibc: /lib exists in filesystem
Errors occurred, no packages were upgraded.

まあ、アップデートかけたらglibcが文句言ってきたので、適当に沈めました。
/lib を消すのはさすがに怖すぎるので、とりあえずエラー吐いてるっぽいglibcだけ後回し。

tomoari:~% sudo pacman -Syu --ignore glibc

これでうまく行ったら、最後にもう一回 –ignore なしでやってみると良い